1 / 20

1 Бурякова М.Е., 1 Орлов А.М., 2 Афанасьев К.И., 2 Шитова М.В.

Генетическая дифференциация популяций трески Gadus macrocephalus Tilesius (G adidae ) по 6 микросателлитным локусам. 1 Бурякова М.Е., 1 Орлов А.М., 2 Афанасьев К.И., 2 Шитова М.В. 1 Всероссийский научно- исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии.

cardea
Download Presentation

1 Бурякова М.Е., 1 Орлов А.М., 2 Афанасьев К.И., 2 Шитова М.В.

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Генетическая дифференциация популяций трески Gadus macrocephalus Tilesius (Gadidae) по 6 микросателлитным локусам 1Бурякова М.Е., 1Орлов А.М., 2Афанасьев К.И., 2Шитова М.В. 1Всероссийский научно- исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии 2Институт общей генетики им.Н.И.Вавилова.

  2. План доклада: 1. Предпосылки к изучению генетической дифференциации трески 2. Цель и задачи исследования 3. Материалы и методы 4. Результаты 5. Выводы 6. Области практического применения генетических исследований тихоокеанской трески

  3. ПОДРАЗДЕЛЕНИЕ ТРЕСКИ НА ПРОМЫСЛОВЫЕ ЕДИНИЦЫ ЗАПАСА В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ ЧУКОТСКАЯ ЗАПАДНО- БЕРИНГОВО- МОРСКАЯ ЗАПАДНО- КАМЧАТСКАЯ КАРАГИНСКАЯ СЕВЕРО- ОХОТОМОРСКАЯ ПЕТРОПАВЛОВСКО- КОМАНДОРСКАЯ КАМЧАТСКО- КУРИЛЬСКАЯ СЕВЕРО- КУРИЛЬСКАЯ ПРИМОРЬЕ И ЗАПАДНО- САХАЛИНСКАЯ ЮЖНО- КУРИЛЬСКАЯ

  4. Цель исследования:Изучить генетическую дифференциацию популяций тихоокеанской трески и выявить её внутривидовую организацию и факторы её формирующие, совмещая полученные данные с результатами других ихтиологических исследований. Задачи исследования: 1. Изучить микросателлитную изменчивость тихоокеанской трески. 2. Исследовать генетическую дифференциацию популяций тихоокеанской трески. 3. На основании полученных генетических данных и данных по биологии трески выявить общие закономерности формирования её внутривидовой популяционной структуры.

  5. Материалы и методы Материалы Места и сроки взятия выборок США Канада Россия 7.07.08. 2 12.11.06. 25.03.10. 24.10.08. 3 4 Берингово море 6 01.09.09. Охотское море 1-Канадские воды 2-Наваринский район Берингова моря 3-Корякский район Берингова моря 4-Карагинский залив 5-Запалная Камчатка, Охотское море 6-Тауйская губа 7-Северо-запад Охотского моря 8- Северные Курилы, охотоморская сторона 9- Северные Курилы, тихоокеанская сторона 10-Кунашир, тихоокеанская сторона 11-Итуруп,тихоокеанская сторона 12-Итуруп, охотское море 13-Западный Сахалин, Японское море 14-Приморье 7 07.11.05. 5 8 9 18.11.08. 1 18.05.07. 15.04.08. 5.06.06. 25.11.09. 13 12 10 18.09.08. 31.10.05. 14 11 Тихий океан 22.10.05.

  6. МетодыСхема проведения молекулярно-генетических исследований РАЗДЕЛЕНИЕ ПОЛУЧЕННОГО ПЦР ПРОДУКТА МЕТОДОМ ЭЛЕКТРОФОРЕЗА СБОР ОБРАЗЦОВ МЫШЕЧНОЙ ТКАНИ ПРОВЕДЕНИЕ ПЦР РЕАКЦИИ ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК ОБРАБОТКА РЕЗУЛЬТАТОВ

  7. Gmo 34 PGmo 32 Gmo 19 Gmo8 Результаты Фенотипы локусов Gma106 Gmo 3

  8. Характеристика микросателлитных локусов

  9. Частота встречаемости аллелей Частота встречаемости аллелей локуса Gmo3 в выборках

  10. Частота встречаемости аллелей локуса РGmo32в выборках

  11. Частота встречаемости аллелей локуса Gmа106в выборках

  12. ПОПУЛЯЦИОННО СПЕЦИФИЧЕСКИЕ АЛЛЕЛИ

  13. ГЕНЕТИЧЕСКОЕРАЗНООБРАЗИЕ ТРЕСКИ В среднем по морям μ – показатель разнообразия, учитывающий частоты редких аллелей (Животовский, 1983); Не– средняя ожидаемая гетерозиготность; Но – средняя наблюдаемая гетерозиготность; f – индекс фиксации (Вейр, 1995); p –вероятность соответствия наблюдаемых генотипических распределений популяций равновесию Харди-Вайнберга (по 6-ти локусам) (уровень значимости: * - 0,05)

  14. Дифференциация популяций Дендрограмма, Qp Gma106 Gmo32 Gmo34 Qp 2,1% 2,4% 3,9% 0,45% 0,33% 0,95% Gma106 Gmo3 Gmo32 Gmo3 Gmo32 Gma106 Gmo8 Gmo3 Gmo19 Gmo3 Gmo32 Gma106

  15. Вклад каждого локуса в дифференциацию популяций

  16. Расположение выборок в пространстве главных координат Россия Канада США Берингово море Охотское море Тихий океан

  17. Индивидуальная идентификация трески ? 94,5% С помощью полученной базы данных возможна индивидуальная идентификация трески с определённой степенью вероятности 89,5%

  18. Выводы: 1. Выявлена значительная гетерогенность популяций тихоокеанской трески на протяжении всего изученного ареала. Выявлены достоверно отличающиеся от других группы популяций тихоокеанской трески. 2. Начато формирование базы данных по частотам аллелей микросателлитных локусов трески. 3. Впервые проведена индивидуальная идентификация трески, показывающая (с определённой степенью вероятности) принадлежность рыб к определённому району обитания.

  19. Области практического применения генетических исследований тихоокеанской трески • Создание биологического обоснования для решения вопросов международного сотрудничества в отношении данного вида (определение внутривидовой генетической подразделённости трески и установление границ её миграций) • Сертификация стад (создание базы данных частот аллелей микросателлитных локусов популяций трески) • Определение точного места вылова рыбы и происхождения рыбной продукции (индивидуальная идентификация)

  20. СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ

More Related