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電子病歷相關編碼說明. 99 年度電子病歷標準維護暨推廣案 教育訓練系列課程 A 電子病歷編碼技術. 本投影片參考來源: 97 及 98 年度電子病歷推動案之專案成果. 大綱. OID 概念 LOINC 編碼 SNOMED CT 編碼. Oid 概念. 物件識別碼 (Object Identifier). 主要是用來做為資訊物件的唯一識別符號,讓資訊在 Internet 上傳遞更為方便與安全,目前許多技術規格都定義必須使用 OID (如: X509(v3) … 等)。 電子化政府的長遠發展:物件 OID 化以統一識別及管理
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電子病歷相關編碼說明 99年度電子病歷標準維護暨推廣案 教育訓練系列課程 A 電子病歷編碼技術 本投影片參考來源:97及98年度電子病歷推動案之專案成果
大綱 • OID概念 • LOINC編碼 • SNOMEDCT編碼
物件識別碼(Object Identifier) • 主要是用來做為資訊物件的唯一識別符號,讓資訊在Internet上傳遞更為方便與安全,目前許多技術規格都定義必須使用OID(如:X509(v3) …等)。 • 電子化政府的長遠發展:物件OID化以統一識別及管理 • 在舊GCA所簽發憑證中的政府機關代碼,在新GCA所簽發憑證已改成為政府機關OID。 • 政府機關OID放在新憑證的用戶目錄屬性延伸欄位中,電子簽章所使用公鑰憑證格式中加解密演算法,擴充欄位皆需一組OID來識別。
重要網站 1. http://asn1.elibel.tm.fr:ASN.1(Abstract Syntax Notation One)網站。 2. http://www.oid-info.com/:OID註冊網站,可以查得所有OID註冊使用情形。有興趣者,可以去查-->1.2.886之結果。 3. http://www.alvestrand.no/objectid:簡單說明何謂OID。 4. OID說明:OID簡介投影片。 5. http://www.hl7.org/oid/index.cfm:HL7總會的OID註冊查詢系統。 6. http://oid.nat.gov.tw/OIDWeb/chmain.html:我國OID查詢網站。 7.http://xca.nat.gov.tw/index.htm: OID申請網站。
HL7之使用情形 • HL7標準中有使用到,尤其是在v3中更列為資料型態的一種。 • 2.14 ISO Object Identifier (OID) specializes UID • HL7總會的OID為:2.16.840.1.113883 • HL7總會亦提供給國際會員國登錄申請。目前有申請的國家有: • HL7 UK 2.16.840.1.113883.2.1 • HL7 Australia 2.16.840.1.113883.2.3 • HL7 Netherlands 2.16.840.1.113883.2.4 • HL7 Switzerland 2.16.840.1.113883.2.5 • HL7 Germany 2.16.840.1.113883.2.6 • HL7 France 2.16.840.1.113883.2.8 • HL7 Argentina 2.16.840.1.113883.2.10
HL7 之OID Tree 2.16.840.1.113883
HL7查詢網頁 可下載OID資料
www.loinc.org 最新版本:2.29 下載須要帳號密碼 可免費申請
LOINC套件內含物 ACCESS 格式 文字檔格式 RELMA安裝程式 (對應工具後續介紹) 使用手冊需另行下載
使用手冊下載 注意:簡體版是舊版本
LOINC簡單說明 • Logical Observation Identifiers Names and Code • 在不同標準間(ASTM E1238, HL7, CEN TC251, DICOM)提供一致性的檢驗項目編碼表達方式。 • 屬HL7所維護的標準。 • CAP(College of American Pathologists)已贊同 (has endorsed) LOINC編碼。 • 已註冊在UMLS(Unified Medical Language System) • HIPAA也已註冊。 • 最新版本2.29,共計有57,475 項。
LOINC所涵蓋專業範圍 • 化學(Chemistry) • 治療藥物監測(Therapeutic Drug Monitoring) • 毒理學(Toxicology) • 血液學(Hematology) • 血清學(Serology) • 血庫(Blood Bank) • 微生物學(Microbiology) • 細胞學(Cytology) • 手術病理學(Surgical Pathology) • 生殖醫學(Fertility) • 獸醫學(Veterinary Medicine)
LOINC所涵蓋臨床應用 • 血壓(Blood Pressure) • 心率(Heart Rates) • 呼吸頻率(Respiratory Rates) • 危重護理指標(Critical Care Measures) • 心輸出量(Cardiac Output) • 體型尺寸(Body Dimensions) • 體溫(Body Temperature) • 攝入(Intake)與排出(Output) • 心電圖(Electrocardiography) • 心臟迴授(Cardiac Echo) • 產科超音波(Obstetric Ultrasound) • 泌尿系統超音波(Urologic Ultrasound) • 胃腸道內視鏡(Gastrointestinal Endoscopy) • 呼吸機管理(Ventilator Management) • 牙科(Dental) • DEEDS急診科報告(DEEDS Emergency Department Reporting) • 放射診斷報告(Radiology Study Reporting) • 申報附件(claims attachment) • 主標題(Major Headings), • 病史(History) • 體格檢查(Physical) • 出院小結(Discharge Summary) • 手術記錄報告(Operative Note Reports) • 腫瘤登記指標(Tumor Registry Variables) • 臨床產科學(Clinical Obstetrics) • 護理觀測指標(Nursing Observations)
LOINC不適用範圍 • 檢測時所使用的儀器設備定義。 • 樣本或採樣部分的具體描述。 • 檢測的優先順序。(急診或常規) • 檢驗結果的審核者。 • 樣本的採集量。 • 採檢或檢驗的地點。 LOINC無法表達者,是放在HL7訊息中 注意:LOINC只有碼,沒有值。
LOINC文法結構 • LOINC的名稱是由六大軸度(或稱為組合、欄位)所形成。 <Analyte/component>: 血糖 <kind of property of observation or measurement>:濃度 <time aspect>: 飯後2小時 <system (sample)>: 血液 <scale>: 定量 <method>: 試紙 <分析物/成分>: (主名稱) <觀測指標或測量指標的屬性類型>: (提供量化屬性) <時間特徵>: (提供時間性資訊) <體系(樣本)>: (提供檢體來源定義) <尺規>: (提供資料之型態與格式定義) <方法> (取得此檢驗值所使用的工具與方法)
六軸編碼簡單說明 • 成分(Component;或分析物、受檢物,Analyte):如鉀(Potassium)、血紅蛋白(Hemoglobin)、C型肝炎抗原(Hepatitis C Antigen)。 • 受檢屬性(Property Measured):如品質濃度(Mass Concentration)、酶活性(Enzyme Activity);(催化速率,Catalytic Rate)。 • 時間特徵(Timing):也就是說,一個檢測指標(Measurement)是片刻或短時間的觀測結果,還是在更長時間段內進行綜合所獲得的觀測結果,如24小時尿液標本(24-hour Urine)。 • 樣本類型(Type of Sample):如尿液(Urine)、全血(Blood)。 • 尺規類型(Type of Scale):即一個檢測指標(Measurement)是定量型(Quantitative)、排序型(Ordinal;一套具有秩次的結果選項)、標題型(Nominal,如E. coli和Staphylococcus aureus),還是敘述型(Narrative,如X射線檢查的口述結果)等。 • 方法(Method):是指在獲得試驗結果或其他觀測結果時所採用的方法(適用情況下方使用的欄位,可選)。
第1軸:<Analyte/component> • 主要標的物名稱。 • 可由三個子軸組合起來,分別為 • (1)主名(principal name)、 • (2)刺激或激發(challenge or provocation)、 • (3)其他標準化或調校(standardization or adjustment)。 • 文法結構 <[analyte].[subclass].[sub-subclass]> ^ <[time delay] post [amount] [substance] [route])> ^ <adjustment>
第1主軸的第1子軸 • <[analyte].[subclass].[sub-subclass]> • [analyte]:檢驗對象主名稱。 • [subclass]:子軸。若主名稱仍可進行分類時。 • [sub-subclass]:次子軸。更細的分類。 • 範例: • Calcium(鈣)本身即可成為主對象。 • Calcium.ionized(鈣離子)就成了另一個檢驗主對象。 • 常見子軸 • 結合型、游離型與生物可利用(bound, free, and bioavailable) • 離子型與非離子型(ionized and non-ionized) • 糖化(Glycated) • 糖醛酸化與非糖醛酸化(glucuronidated and non-glucuronidated ) • 抗體亞種修飾語: IgA、IgD、IgE、IgG和IgM。
第1主軸的第2子軸 • <[time delay] post [amount] [substance] [route])> • [time delay]:延後時間。可查手冊表4。 • [amount]:使用量。 • [substance]:藥物。 • [route]:途徑。(使用HL7 table 0162:Route of administration) • 範例 Aldosterone^1H post 25 mg captopril PO 口服25mg卡托普利1小時後的醛固酮
第1主軸的第3子軸 • <adjustment> • 調整或校正某一測定值的計算方法 • 範例 • pH調整至7.4的條件下,對患者血清或血漿標本中離子鈣的定量檢測 • Calcium.ionized^^adjusted to pH 7.4:SCnc:PT:Ser/Plas:Qn 其實有第四子軸,但只用於HL7訊息批次交換時,作為序號之用。
第2軸:<kind of property of observation or measurement> • 對主名進行屬性規範(量化比較多)。 • 主要屬性類別: • 質量(Mass):質量單位Milligrams, Grams。 • 物質(Substance):濃度單位莫爾或毫當量。 • 催化活性(Catalytic activity ):催化劑濃度。 • 任意(Arbitrary):任意測量單位(非上述者) • 數量(Number):計數型資料。 • 內容很多,需參考LOINC Table 8 : Example LOINC properties。
第3軸:<time aspect> • 說明測定此檢驗項目可能發生的時間點(Point)或時距(Time Interval)。 • 經由時間所衍生的平均速率(排泄率、清除率)。 • 經由時距衍生了取樣間隔(分晝/夜尿量)。 • (注意,有些需與第2軸一致,如Moles Per Day (Hours)。 • 持續性時間的表達,應參考LOINC Table 9: Example Duration Categories。 • 常用者: • PT: at a Point in Time. 隨機的某時點。 • Stdy: Duration of the study.檢查期間。 • Enctr:Duration of an encounter (hospital stay, visit). 就診期間。 • 可有第2子軸(Time Aspect Modifier),修飾前第1子軸。參考LOINC Table 10: Time Aspect Modifier Codes
範例 8H^max heart rate 8小时最大心率
第4軸:<system (sample)> • 體系或樣本類型描述。又可分兩個子軸。 • 第一子軸:主要命名 • 體系大分類 • 血液(Blood)、尿液(Urine)、腦脊液(Cerebrospinal Fluid,CSF)、胸水(Pleural Fluid)、滑膜液(Synovial Fluid)、腹膜水(Peritoneal Fluid) • 詳細體系與樣本代碼,參考Table 11: Example Laboratory System/Sample Types 。若此檢驗項目含多個體系,則可用”+”連接。 • 第二子軸:超體系(Super System) • 一般體系或樣本都是來自預設的^Patient。假若不是則需進一步說明。如胚胎(fetus)、捐贈者(donor)、血品(BPU)、母親(mother)等。
第4軸:<system (sample)> • 範例: A Ag:ACnc:Pt:RBC:Ord與 A Ag:ACnc:Pt:RBC^BPU:Ord 分別取得病患與捐贈者的紅血球A型抗原。 A Ag:A型抗原 ACnc:任意濃度 Pt:某時點 RBC:紅血球^(病患) RBC^BPU:紅血球^捐贈者
第5軸:<scale> • 此為必要軸,用以說明此檢驗項的尺度(類似資料型態的概念) 數量形式 排序形式 前面兩種 標題形式 敘述形式 備忘形式 文檔形式
第6軸:<method> • 相同成分(分析物)若使用不同檢測方法時,由此軸來區別。為可選軸。 • 檢測方法相當複雜,大分類: • DNA/RNA probes/measures (探針/量測) • 要參考表14A與14B • Immunofluorescence(免疫螢光) • Immune Stain (免疫染色) • Enzyme Immunoassay (酶免疫測定) • Coagulation (凝血測試) • Stains (染色測試) • Clinical measures (臨床評估) • Imaging studies (影像檢查)
LOINC資料庫欄位說明 附錄A說明資料庫欄位結構 其他欄位皆是管理用途
SNOMED CT簡介 • 主要是透過Concept、Description與Relationship三個重要元素建構Term之描述。 • concept:(概念) • 具有臨床上意義者,有唯一辨識碼(ConceptID)。 • 文字表現上是以人可閱讀之描述,此名稱特殊定義為Fully Specified Name(FSN) • 每個concept會與其他的concept有關連。 • Concept Granularity: (概念尺度):如右圖
SNOMED CT簡介 • Descriptions:(描述) • 描述是用一個term(片語)或name(名詞)來說明概念。 • 每個描述都有自己的DescriptionID(描述代碼)。 • 一個概念代碼可能會有多個描述代碼。 • 例如:概念代碼2229806的描述代碼有: • Fully Specified Name: Myocardial infarction (disorder): • DescriptionID 751689013 • Preferred term: Myocardial infarction: • DescriptionID 37436014 • Synonym: Cardiac infarction: • DescriptionID 37442013 • Synonym: Heart attack: • DescriptionID 37443015
SNOMED CT簡介 • Relationship: (關連) • 概念與概念間有四種關類型: • Defining(定義) • Qualifying(限制) • Historical(歷史) • Additional(附加) • 每一個概念是透過與其關連的概念,做邏輯上定義。 • 除了根概念(SNOMED CT Concept)外,每一個使用中(Active)概念,至少會有一個IS_A與父概念關連。 • IS_A關連就是一種定義特性(defining characteristics) • 關連又是透過一些屬性定義描述之。(約50多種屬性)
CliniClue軟體工具簡介 • SNOMED CT查詢輔助軟體 • 網址:http://www.cliniclue.com/
概念代碼 描述代碼 屬性 結構 關聯
HL7 v3對SNOMED CT之支援 • 資料型態CD(Code Description)可以配合SNOMED之描述。
HL7 v3對SNOMED CT之支援 <code codeSystem="2.16.840.1.113883.6.96" code="195967001" displayName="asthma"> <qualifier> <name code="246112005" displayName="severity"/> <value code="24484000" displayName="severe"/> </qualifier> </code>
Observation • 代表一個檢驗編碼或者其他觀測值 • 透過referenceRange連結至ObservationRange,可設定觀察值之上下限值
RegionOfInterest • 醫師在圖片上之描述,設定有興趣的部分。 • 繪圖區塊形狀定義在RegionOfInterest.code。 • 共計有四種編碼: • CIRCLE:圓形 • ELLIPSE:橢圓 • POINT:點 • POLY:多邊形