Travail paraclinique de génétique 2 eme doc

1. Travail paraclinique de génétique 2eme doc BESSE Mélanie DEWAIDE Frédérique HERVEY Audrey

2. Objectifs Analyse mixte à 2 variables pour étudier la relation entre le poids corporel et les indicateurs d’ascite chez les poulets de chair. Pourquoi ? Ascite = source de pertes sévères dans les poulaillers (1 billion $/an !!!)

3. Plan • Symptômes de l’ascite • Matériel • Méthodes • Résultats • Conclusions de l’article • Critiques • Notre conclusion • Bibliographie

4. Symptômes de l’ascite • 1er signe clinique : hypoxie car la demande en 02 est augmentée et dépasse la capacité pulmonaire  hypertension pulmonaire + hypertrophie du ventricule droit et de la valvule auriculo-ventriculaire droite • Changement hématologique :  de l’hématocrite et de la viscosité sanguine

5. Matériel • Paramètres d’ascite :  HCT = valeur d’hématocrite  RV:TV = rapport poids ventricule droit sur poids total du ventricule  LIV = Couleur et surface du foie  HRT= accumulation de liquide dans la cavité cardiaque  ABD = accumulation de liquide dans la cavité abdominale

6. Matériel • Animaux : Poulets de chair de race White Plymouth Rock Utilisation de la 3eme génération issue du croisement suivant : • Femelle de haute performance reproductive et à plumage solide • Mâle à croissance rapide et plumage tardif

7. Matériel • Conditions d’élevage des animaux: 2,98kcal/kg avec 21% de protéine 23h/j de lumière artificielle 20 animaux/m2 • 2 groupes sont constitués: Groupe 1 (4202) : naissance=30°  jusqu’à 10° à 22j10° jusqu’à 35j (abattage) Groupe 2 (795) : naissance=34°  jusqu’à 18° à 35j18°jusqu’à 49j (abattage)

8. Matériel • Modèle mixtebivariable: Utilisé pour séparer les populations hétérogènes en les assignant à une distribution quand les paramètres seuls ne permettent pas de classer les individus.

9. Matériel • modèle • µ1,1 et σ1,1 : moyenne et déviation standard du premier indicateur dans la distribution 1 • µ1,2 et σ1,2 : moyenne et déviation standard du second indicateur dans la distribution 1 • P : Fréquence des oiseaux de la distribution 1 • ρ1 : corrélation entre les indicateurs dans la distribution 1

10. Méthode • Mesures avant abattage : BW HCT • Mesures après abattage : • RV:TV • LIV • HRT grade : 0(normal), 1, 2(pathologique++) • ABD }

11. Résultats 1.Mesure des moyennes et déviations standard pour les différents paramètres d’ascite en condition froide et normale. Moyennes HCT et RV:TV > et moy BW < en conditions froides (pas significatif pour les autres paramètres) Déviation standard > en conditions froidespopulation plus hétérogène

12. Résultats • Les distributions en conditions froides sont plus étalées. Hypothèse : ce groupe 1 est un mélange de sous populations aux caractéristiques différentes Conditions froides

13. Résultats 2. Application du modèle mixte bivariable aux paramètres HCT et RV:TV en conditions froides Sur le graphique ainsi obtenu le score des autres indicateurs (HRT, LIV, ABD) sont ajoutés 2 sous groupes de poulets apparaissent: - Poulets sans ascite: petites valeurs HCT et RV:TV et pas de signes sévères d’ascite (HRT=1) - Poulets avec ascite: hautes valeurs HCT et RV:TV et signes significatifs d’ascite

14. Résultats 3. Mesure moyenne et écart standard des paramètres d’ascite dans les 2 sous populations en conditions froides et applications du modèle mixte bivariable

15. Résultats • La fréquence estimée des oiseaux ascites P < à 1  preuve d’un mélange de 2 distributions dans les conditions froides. • Groupe des poulets ascites: Moyenne RV:TV HCT > Corrélation HCT RV:TV positive Corrélation BW RV:TV et BW HCT negative • Groupe des poulets sans ascite: Corrélation proche de 0

16. Résultats 4. Mesures de corrélations en conditions froides et normales Corrélations BW RV:TV et HCT ainsi que HCT RV:TV du groupe au froid > s’explique par une forte corrélation chez les poulets ascites de ce groupe

17. Conclusion de l’article • Une corrélation entre le poids (BW) et les paramètres d’ascite (RV:TV et HCT) n’est significative que dans la sous population de poulets avec ascite en condition froide. Cette corrélation est négative.  Croissance moins importante des poulets à RV:TV et HCT élevés donc de ceux atteints d’ascite • La corrélation totale entre le poids (BW) et les paramètres d’ascite (RV:TV et HCT) dans le groupe au froid est dépendante de la fréquence d’ascite dans ce groupe.

18. Critiques • Dans les groupes 1 et 2 : - taille de groupes et date d’abattage différentes - temps d’exposition aux conditions différent • Dans les sous populations, au froid : - les indicateurs d’ascite ne sont pas tous mesurés sur les mêmes individus - nombre d’individus ascite/sans ascite pris en compte pour l’analyse statistique ??? • Poulets au score HRT=1 considéré comme non ascite !?

19. Critiques • Littérature précédente : corrélation entre BW et Ascite positive Les poulets à croissance rapide ont plus tendance à développer de l’ascite lié à un plus fort déséquilibre entre le besoin et l’apport en O2. • Présente étude : corrélation entre BW et Paramètres d’ascite négative en conditions froides!!! Ces conditions stressantes  la conso d’O2 (lutte contre le froid) et  l’immunité  affaiblissement des poulets (moyenne des poids < en conditions froides) Les poulets les plus faibles seront plus sensible à l’ascite.

20. Critiques • Présente étude :pas de corrélation entre BW et Paramètres d’ascite en condition normale d’élevage !!! - Ne travail pas sur des poulets à croissance rapide mais sur un croisement - taille de groupe insuffisante (795)

21. Notre conclusion • Dans les conditions normales d’élevage, les températures sont maintenues strictement au dessus de 22°C. • L’existence d’une corrélation entre le BW et les indicateurs d’ascite à 10°C n’a pas d’intérêt en élevage industriel. • Une corrélation en condition normale d’élevage aurait présentée un intérêt en sélection génétique des poulets.

22. Bibliographie ZEREHDARAN S., VAN GREVEHOF E.M., VAN DER WAAIJ E.H., BOVENHUIS H. 2006. A bivariate mixture model analysis of body weight and ascites traits in broilers. Poultry Science 85:32-38