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Carbossipeptidasi

Carbossipeptidasi. Equilibrium:. ES. E + S. E + P. ES. ES. E + S. E + S. E + P. E + P. All’inizio:. k 1. k 2. formazione del prodotto: velocità V 0 = k 2 [ES] formazione del complesso ES: velocità V 1 = k 1 [E][S]

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Presentation Transcript

  1. Carbossipeptidasi

  2. Equilibrium: ES E + S E + P ES ES E + S E + S E + P E + P All’inizio: k1 k2 formazione del prodotto: velocità V0 = k2[ES] formazione del complesso ES: velocità V1 = k1[E][S] scissione del complesso ES: velocità V-1 + V0 = k-1[ES] + k2[ES] Allo stato stazionario [ES] è stabile: formazione del complesso ES = scissione del complesso ES k1[E][S] = k-1[ES] + k2[ES] [E][S] k-1 + k2 [ES] k1 KM: costante di Michaelis-Menten [E][S] = KM[ES] k-1 = = KM

  3. Sappiamo che [Etotale] = [E] + [ES] cioè [E] = [Etotale] – [ES], perciò ([Etotale] – [ES])[S] = KM[ES] [Etotale][S] = KM[ES] + [ES][S] = (KM + [S])[ES] [Etotale][S] (KM + [S]) = [ES] Formazione del prodotto: velocità V0 = k2[ES] k2 [Etotale][S] (KM + [S]) V0 = [E][S] = KM[ES] Problema: non conosciamo KM, [E] e [ES] La massima velocità si raggiunge quando tutti i siti catalitici sono saturati con il substrato, cioè quando [Etotale] = [ES] Massima velocità: Vmax = k2[Etotale]

  4. L’equazione di Michaelis-Menten: Quando [S] >> KM, V0 = Vmax Quando [S] = KM, V0 = Vmax/2

  5. Grafico di Michaelis-Menten (Cinetica di Michaelis-Menten) KM = costante di Michaelis-Menten

  6. Equazione di Lineweaver & Burk: 1 KM 1 1 V0Vmax [S]Vmax x = ay + b = +

  7. Grafico di Lineweaver-Burk (grafico dei doppi reciproci)

  8. KM: (spesso) una misura dell’affinità per il substrato. (1100) 0.66 Campbell 5.0 Stryer Anidrasi carbonica CO2 12 Campbell 8 Berg Stryer

  9. kcat: il numero di turnover di un enzima il numero di molecole di substrato che vengono convertite in prodotto da una molecola di enzime nell’unità di tempo (normalmente 1 secondo) quando l’enzima è completamente saturato dal substrato. kcat = Vmax/[Etotale] Normalmente kcat corrisponde alla costante di velocità della tappa limitante del ciclo catalitico.

  10. Voet 10,000,000 600000 Str 25000 Str,

  11. Chimotripsina

  12. Reazioni con più substrati

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