1 / 24

ASAM NUKLEAT

ASAM NUKLEAT. Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan: a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi. Base. PO 4. Sugar. Nukleotida.

nuru
Download Presentation

ASAM NUKLEAT

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. ASAM NUKLEAT DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  2. Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan: a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  3. Base PO4 Sugar Nukleotida Asam nukleat dibentuk dari nukleotida yg memiliki suatu gula, basa nitrogen, dan fosfat. Nukleosida DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  4. Molekul Gula pada Nukleotida • Ribosa merupakan penyusun utama DNA • 2-Deoksiribosa merupakan molekul gula pada DNA Perhatikan: • Ikatan gula ribosa dengan basa nitrogen (pada atom karbon nomor 1). • Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat (pada atom karbon nomor 5). • Gugus hidroksil pada atom karbon nomor 2 DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  5. Basa Nitrogen • Basa nitrogen berikatan dengan ikatan-β pada atom karbon nomor1' dari gula ribosa atau deoksiribosa. • Pirimidin berikatan ke gula ribosa pada atom N-1dari struktur cincinnya. • Purinberikatan ke gula ribosa pada atom N-9 dari struktur cincinnya. DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  6. Ribonukleotida – penyusun RNA • Gula ribosa yang berikatan dengan basa nitrogen (dalam contoh di samping adalah suatu pirimidin, urasil dan sitosin) pada atom karbon nomor 1‘nya disebut ribonukleosida (dalam contoh di samping adalah uridin dan sitidin). • Ribonukleosida yang terfosforilasi pada atom karbon nomor 5‘nya disebut ribonukleotida (dalam contoh di samping adalah uridilat atau sitidilat) Penyampaian ribonukleotida biasanya dalam bentuk singkatan (misalnya) U, atau UMP (uridin monofosfat) DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  7. Ribonukleotida utama: Perhatikan atom N9 (pada purin) dan N1 (pada pirimidin) yang berikatan dengan atom C nomor 1’ dari ribosa DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  8. Deoksiribonukleotida – penyusun DNA • Gula 2'-deoksiribosa yang berikatan dengan basa nitrogen (dalam contoh di samping adalah purin; adenin dan guanin) pada atom karbon nomor 1‘nya disebut deoksiribonukleosida (dalam contoh di samping adalah deoksiadenosin dan deoksiguanosine). • Deoksiribonukleosida yang terfosforilasi pada atom karbon nomor 5‘nya disebut deoksiribonukleotida (dalam contoh di samping adalah deoksiadenilat dan deoksiguanilat). Penyampaian deoksiribonukleotida biasanya dalam bentuk singkatan (misalnya) A, atau dA (deoksiA), atau dAMP (deoksiadenosin monofosfat) DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  9. Deoksiribonukleotida Utama: Perhatikan atom N9 (pada purin) dan N1 (pada pirimidin) yang berikatan dengan atom C nomor 1’ dari ribosa DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  10. Penamaan Nukleotida: DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  11. Penamaan Nukleotida: Nukleosida Difosfat dan Nukleosida trifosfat DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  12. Senyawa Siklik AMP, Adenosin 3`-monofosfat, dan Adenosin 2`,3`- monofosfat DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  13. Struktur Primer DNA dan RNA A, G, T, C  DNA A, G, U, C  RNA ikatan phosphodiester Ikatan kovalen yang terjadi antara gugus phosphate pada satu nukleotida, dengan gugus OH pada nukleotida lainnya. DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  14. Struktur tulang punggung DNA, RNA DNA: 5’-ACGTA-3’ /pApCpGpTpA RNA: 5’-ACGTA-3’ /pApCpGpTpA ?? DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  15. Struktur sekunder DNA dan RNA DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  16. DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

  17. Analisisdna

  18. Ekstraksi DNA Pengendapan DNA olehisopropanol Lisisdindingseldanmembran sentrifugasi Sentrifugasikembali larutkan DNA Cuci DNA denganetanol

  19. Kualitas DNA 12,000,000bp Ukuran DNA genomdrbeberapa Species (kbp) E. Coli 4,640,000 bp Yeast 12,100,000 bp Fruit Fly 140,000,000 bp Human 3,000,000,000 bp Pea 4,800,000,000 bp Wheat 17,000,000,000 bp 1 kbp and 100 bp ladders Genomic DNA of 5 species of cereals

  20. DNA plasmid

  21. Kualitas DNA A B C D E Ladder Intensitasrendah Jumlahsedikit/tipis Tdkadapemurnian phenol RNA

  22. Konsentrasi DNA Spektrofotometer (UV):  260 nm. Optical Density Wave Length 260

  23. Total RNA, diisolasidarijaringantikusmenggunakan EXT-0003 lane 1: total RNA bag Otak. lane 2: total RNA bag hati lane 3: total RNA bag paru-paru lane 4: total RNA bag limpa Pita rRNA (ada 2, ukuran besar dan kecil), smear kemungkinan mRNA dgn berbagai ukuran. Pita yg Paling bawah tRNA Total RNA terlihat baik, bila proses ekstraksi baik Total RNA: rRNA, tRNA, dan mRNA Kira-kira 95-98% adalah rRNA

  24. Aplikasi DNA Ubur-ubur goresan bakteri mengekspresikan GFP Struktur 3D GFP (Green Fluorescent Protein) GFP Pada Macaca GFP Pada Mencit DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

More Related