Oddelenie b iofyzik y

1. Oddelenie biofyziky • Smery výskumu : • Stabilita a funkcie biomakromolekúl • Konformačné prechody biomakromolekúl • Vplyv biologicky aktívnych látok na amyloidné štruktúry • Vývoj supramolekulárnych komplexov nanočastíc s biomolekulami • Elektrostatické interakcie polyelektrolytov • Obrazová analýza biologických objektov • Molekulárnemodelovanie

2. Projekty riešené na OBF • VEGA: (5) • Molekulárne mechanizmy konformačnej stability proteínov (M.Antalík) • Agregácia proteínov a identifikácia inhibítorovagregácie (Z. Gažová) • Molekulárne modelovanie interakcií dendrimérov s liečivami za účelom • využitia týchto komplexov ako presných nanočastíc pre „drug- • delivery“ systémy(T. Kožár) • Interaktívne algoritmy segmentácie na báze aktívnych kontúr a ich • uplatnenie pri meraní fyzikálnych vlastností biomedicínskych objektov (Z. Tomori) • APVV: (3) • 1-Methoxyindolové fytoalexíny a ich analanalógy ako nový typ zlúčenín • s protinádorovou aktivitou(T. Kožár) • Vytvorenie virtuálneho laboratória na účinnú analýzu ligandov a • ligand-receptor interakcií(T. Kožár)

3. Publikácie: • CC: Výjdené: • ANDRE, S. - KOŽÁR, T. - SCHUBERTH, R. - UNVERZAGT, C. - KOJIMA, S. - GABIUS, H.J.Substitutions in the N-Glycan Core as Regulators of Biorecognition: The Case of Core-Fucose and Bisecting GlcNAc Moieties.Biochemistry. Vol. 46, no. 23 (2007), 6984-6995. (IF 3.63) • TOMÁŠKOVÁ, N. - VARHAČ, R. – ŽOLDÁK, G. – OLEKŠÁKOVÁ, L. – SEDLÁKOVÁ, D. – SEDLÁK, E.Conformational stability and dynamics of cytochrome c affect its alkaline isomerization.J. Biol Inorg. Chem. 12, (2007), 257-266. (3.224 - IF) • HEFFERAN, M.P. – KUCHAROVA, K. – KINJO, K. – KAKINOHANA, O. – SEKERKOVA, G. – NAKAMURA, S. – FUCHIGAMI, T. – TOMORI, Z. – YAKSH, T.L. – KURTZ, N. – MARSALA, M.Spinal Astrocyte Glutamate Receptor 1 Overexpression after Ischemic Insult Facilitates Behavioral Signs of Spasticity and Rigidity.J. Neurosci. 17, no. 27 (2007), 11179-11191. (IF - 7.45) • KOŇÁK, Č. - SEDLÁK, M.pH-Sensitive Micelles Formed by Interchain Hydrogen Bonding of Poly(methacrylic acid)-block-Poly(ethylene oxide) Copolymers.Macromolecular Chemistry and Physics. 208, (2007), 1893-1899. • (IF 2.02) • M. Pickhardt, Biernat J., Khlistunova I. Wang Y.P., Gazova Z., Mandelkow E.M., Mandelkow E. N-Phenylamine Derivatives as Aggregation Inhibitors in Cell Models of Tauopathy.Current Alzheimer Research, 4 (2007), 397-402 – nie je uvedený ústav • Zaslané: • S. Poniková, M. Antalík, T. Hianik • A CD spectroscopy study of the formation of guanine quadruplexes by DNA aptamers that selectively • bind thrombin at different exosites. Effect of potassium and sodium ions. • Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters • J. Bágeľová, D. Fedunová, Z. Gažová, M. Antalík, • Different effect of sorbitol and NaCl on native and acid unfolded cytochrome c” • Biophysical Chemistry • R. Varhač, M.Antalík • Binding of cyanide to ferricytochrome c in acidic pH region • J. Biol. Inorg. Chemistry • Z. Gazova, A. Bellova, J.Imrich, P. Kristian, Z. Daxnerova, J. Bagelova, D. Fedunova and • M.Antalik Acridine derivatives inhibit lysozyme aggregation • Europ. Biophys. J.

4. Pozvané prednášky: • Z. Gažová – Amyloid structures, ISMN CNR Bologna, Taliansko – 13-16 Február 2007 • Z. Gažová – Amyloid structures, BIODOT Meeting, Budapest, Maďarsko, 7.-8. máj 2007 • KOŽÁR, T. Clusters, Grids & Molecules: Virual Screening. In Grid for Pharmaceutical & Biomedical Challenges. EGEE Industry Day Bratislava, Slovakia, 19 September 2007 • KOŽÁR, T.High-throughput computing in molecular modeling and design. In 3rd International Workshop on Grid Computing for Complex Problems, Bratislava, Slovakia, October 22-23, 2007 • Konferenčné príspevky: 15

5. Organizácia konferencií: • Medzinárodná konferencia • 5. ročník - Štruktúra a stabilita biomakromolekúl (5-8. 9. 2007 Košice) • plus satelitná konferencia Moderné trendy vo výskume biomakromolekúl • Pedagogika: • PF UPJŠ v Košiciach M. Antalík (prednášky Biochémia I , Biofyzikálna chémia I a II ) Z. Gažová (prednášky Enzymológia ) • FEI TU Z. Tomori (prednáška Počítačové videnie)    • Diplomové práce: 6- (Z.Gažová, D. Fedunová, E. Valušová)

6. Supramolekulárne štruktúry- Nanočastice biomakromolekuly • Cieľ: Vytvoriť metodický základ na syntézu a charakterizovanie nanočatíc • tri základné typy nanočastíc : plasmónové ( Au, Ag, Cu) • kvantové body ( ZnO, ZnS) • biokeramické (hydroxyapatit) • Dimenzionalita 0., 1., 2., 3.D • Rok 2007 sústredenie na prípravu a izoláciu Au a Ag nanočastíc pasivovaných s glutationom • Vlastnosti nanočastíc sú výrazne ovplyvnené veľkosťou a tvarom. • Pri syntéze vznikajú vždy rozdielne štruktúry nanočastíc. S využitím techník používaných pri izolácii biomakromolekúl je možné získať chemicky čisté veľkosťou a tvarom rovnaké nanočastice.

7. PAGE elektroforéza Ag-glutation (Au- glutation)nanočastíc syntetizovaných mokrou cestou v rôznych koncentračných pomeroch reaktantov- • Tieto nanočastice vytvárajú komplexy s cytochrómom c pričom zvyšujú jeho stabilitu v okolí hemu. • Zlaté nanočastice majú výrazne protiagregačné vlastnosti na amyloidné štruktúry • V súčasnosti prebieha charakterizácia ich magnetických vlastností.

8. ďakujem za pozornosť