Service de Bactériologie Département des Maladies infectieuses et parasitaires Faculté de Médecine Vétérinaire

1. Service de BactériologieDépartement des Maladies infectieuses et parasitairesFaculté de Médecine Vétérinaire Cours de bactériologie 2ème doctorat Option Rente Les salmonelloses

2. Les maladies du tube digestif • Intestins Entérites aigües et entérotoxémies • colibacilloses • salmonelloses - diarrhée: tous (jeunes et adultes) - septicémie: tous (nouveau-nés, jeunes et adultes) - avortement: tous (femelles pleines) • clostridioses • autres bactéries

3. Les maladies du tube digestif SALMONELLOSES Incidence: • tous les âges sont réceptifs • pic chez les jeunes • bovins: fréquentes, surtout en groupe • petits ruminants: fréquentes, surtout en groupe • porcs: très fréquentes (surtout en post-sevrage) • chiens/chats: fréquentes (cas individuels) • chevaux: fréquentes (cas individuel, post-hospitalisation) • lapins: fréquentes (élevages) • autres mammifères: variables (cas individuel) • volaille: fréquentes (+ portage) • autres oiseaux: variables • reptiles: moins fréquentes (autres sérotypes) Pouvoir zoonotique: transmission directe, par les denrées alimentaires, par les eaux de baignade

4. Les maladies du tube digestif SALMONELLOSES Etiologie:Salmonella enterica sérovars … • Typhimurium: tous • Dublin: ruminants • Choleraesuis, Derby, Panama, Goldcoast, Livingstone:porc • Anatum, Agona, Hadar, Newport, St-Paul:cheval • California, Hadar, Newport: chien, chat • Virchow, Enteritidis, Agona: volailles ! Variations des sérovars au cours du temps et de l’âge !

5. Les maladies du tube digestif SALMONELLOSES Diagnostic • Circonstances • âge, stress • clinique • trilogie: diarrhée (dysenterie), septicémie, avortement • nécropsique • lésions intestinales (grêle): congestion, hémorragies, nécrose • lésions généralisées: pétéchies, hémorragies, foyers de nécrose • Etiologique • culture après enrichissement • sérotypage et lysotypage • Sérologique • sur sérums couplés

6. Cours de bactériologie 2ème doctorat Option Rente • Les salmonelloses: • Le typage des salmonelles animales: comment ? pourquoi ? (Dr Vét Hein Imberechts, CERVA-CODA) • Le vétérinaire d’abattoir face aux salmonelles (Prof. Georges Daube, DDA) • La clinique des salmonelloses chez l’homme (Dr Christiane Duchesnes, MG) • Le typage des salmonelles humaines: comment ? pourquoi ? (Dr Katelijne Dierick, ISP Louis Pasteur WIV)

7. Salmonella dans la production primaire Dr H. Imberechts Laboratoire National de Référence pour Salmonella,Santé animale

8. Contenu • Salmonella et salmonellose • Programmes officiels de l’AFSCA en production primaire • Le sérotypage • La résistance aux antibiotiques • Evolution de Salmonella en Belgique

9. Salmonella • Isolement (ISO 6579:2002 Annexe D) • Pré-enrichissement : BPW • Enrichissement sélectif : RVS, MKTTn (MSRV) • Sur milieu sélectif : BGA, XLD (XLT4) • Identification biochimique • Typage • Phénotypique: LPS et flagelles • Génétique (PFGE)

10. Infections à Salmonella • La volaille et le porc • Souvent absence de signes cliniques • Excrétion par matières fécales et oeufs • Contamination de la chaîne alimentaire • Chez l’homme: typhoïde < non-typhoïde (voir par après)

11. Programmes officiels de l’AFSCA • Chez les volailles reproductrices • Chez toutes les volailles avant l’abattoir (OUT; Qualification sanitaire) • Chez les porcs à l’engrais • Principalement sérologie • Chez les poules pondeuses: prévue en 2007

12. Programmes officiels de l’AFSCA • Volailles reproductrices • Echantillons officiels: 22 sem, +6 sem • Laboratoire ARSIA • Poules pondeuses & poulets de chair • Echantillonage par le détenteur: OUT • Laboratoires ARSIA et privés (agréés) • Poules pondeuses en 2007 • Echantillons obligatoires: 16, 22, 46 sem • Laboratoire ARSIA

13. AFSCA: Mesures • Volailles reproductrices • Destruction des oeufs, ou pasteurisation • Abattage (logistique) • Nettoyage et désinfection • Poules pondeuses & poulets de chair • Pasteurisationdes oeufs • Abattage logistique • Nettoyage et désinfection

14. Programmes officiels de l’AFSCA (Agence fédérale pour la sécurité de la Chaîne alimentaire) • Sérotypes principaux: • S. Enteritidis, S. Typhimurium • EU (Règlement 1003/2005) • S. Enteritidis • S. Typhimurium • S. Hadar • S. Infantis • S. Virchow • Déclaration à l’AFSCA

15. La sérotypie • Technique: agglutination • Sérotype = formule • Antigène O: LPS, sucres • Antigène H: flagelles, protéines • Deux phases: H1 et H2 • Exemples: O H1 H2 • Enteritidis 9 g,m - • Typhimurium 4[5] i 1,2 • Virchow 6,7 r 1,2

16. Exemples • S Typimurium • Paratyphi B 1,4,[5],12 b 1,2 • Typhimurium 1,4,[5],12 i 1,2 • Lagos 1,4,[5],12 i 1,5 • Agama 4,12 i 1,6 • Gloucester 1,4,12,27 i l, w • S Enteritidis • Enteritidis 1,9,12 g,m – • Blegdam 9,12 g,m,q – • II salamae1,9,12 g,m,[s],t [1,5,7],[z42] • II salamae1,9,12 g,m,s,t e,n,x

17. La sérotypie, difficultés • Long trajet • Récolte, transport, enregistrement, tests biochimiques, sérotypie, réponse • Accord entre partenaires est nécessaire • Difficultés techniques • H1 et H2 (Sven Gard, deuxième phase) • Faible expression / antisérum incertain • Tests biochimiques nécessaires • S. Enteritidis et vaccin vivant • S. Gallinarum subsp Gallinarum / Pullorum • S. Paratyphus B var Java (tartrate pos)

18. La résistance aux antibiotiques • Une sélection de souches est testée contre 12 antibiotiques • Résultats 2005: • La plupart des Salmonella: presque toutes sensibles • SE: presque toutes sensibles • S Hadar: presque toutes résistantes • ST, Blockley, Paratyphi B, Virchow: multi-résistantes • Pas de résistance à la fluoroquinolone • Rapport final: http://www.var.fgov.be • Rapport des zoonoses: http://www.favv.be

19. Résistance aux antibiotiques Toutes les salmonelles Salmonelles bovines Salmonelles porcines Salmonelles aviaires

20. Evolution Volaille

21. Evolution porcs

22. Evolution bovins

23. Salmonella entericachez l’homme C. Duchesnes

24. Points communs Tropisme entérique: symptomatologie digestive Transmission par voie féco-orale Contagiosité : germe dans les selles Saison chaude Déclaration obligatoire Salmonelloses

25. Points distincts Réservoir Homme Homme et animal Incubation ~ 2 semaines ~ 1 jour Incidence en Belgique ~ 10 cas / an dont la moitié sont importés ~ 10 000 cas / an Tableau clinique et évolution sans traitement Invasive 20 % mortalité En général, peu inquiétant <1% mortalité Salmonelles « majeures » Salmonelles « mineures » S. Enteritidis S. Choleraesuis S. Typhimurium … S. Typhi S. Paratyphi

26. Fièvres typhoïde et paratyphoïde Réservoir: Homme (malade ou porteur sain) Contamination: ingestion d’aliments et d’eau contaminés par les selles  touchent surtout les pays à bas niveau sanitaire

27.  lésions intestinales Diarrhée ou constipation Hémorragies digestives Péritonite Cholécystite  libération de l’endotoxine Troubles neuro-végétatifs Atteinte du myocarde Atteinte de l’os Fièvres typhoïde et paratyphoïde Physiopathologie Bactéries invasives Tableau clinique-Complications  bactériémie Fièvre

28. Fièvres typhoïde et paratyphoïde Traitement Antibiothérapie variable selon l’âge et le pays Prévention Distribution d’eau de qualité Traitement des eaux usées Contrôle des zones de récolte de coquillages Pasteurisation des aliments Vaccin  Boil it, cook it, peel it or … forget it !

29. Incubation: 1 jour Tableau clinique de gastroentérite Fièvre Diarrhée Vomissements Douleurs abdominales Evolution Spontanément favorable en 3 à 5 jours pas d’antibiotiques Salmonelloses « mineures » Réservoir: Tube digestif de l’homme et de l’animal Contamination: orale (aliments souillés ou objets contaminés)

30. Tableau clinique de gastroentérite Fièvre Diarrhée glairo-sanglante Vomissements Douleurs abdominales Méningites Ostéites Traitement Antibiothérapie Salmonelloses « mineures » Personnes à risque Enfants < 3 mois et personnes âgées Femmes enceintes Personnes immuno-déprimées

31. Prévention Contrôle sanitaire des animaux Ecartement des lieux communautaires (crèche) Ecartement des travailleurs du domaine agro-alimentaire Sensibilisation aux mesures d’hygiène entérique (port de gants, de tablier) Salmonelloses « mineures » • Cas isolé • TIAC Toxi-infections alimentaires collectives (≥ 2 cas groupés) • Epidémie: plusieurs foyers Contamination: orale (aliments souillés ou objets contaminés)

32. Retracer l’origine alimentaire lors d’une toxi-infection collective à Salmonella Dr.Vét. Katelijne Dierick Institut Scientifique de Santé Publique Section Bactériologie 1 Rue Juliette Wijtsman 14 1050 Bruxelles

33. Contenu • Definitions et situation belge • Une TIAC simple • Une épidémie en Belgique • Une épidémie internationale

34. Définition TIAC • Toxi-infection alimentaire collective(TIAC) :apparition d’au moinsdeux cas groupés similaires d’une symptomatologie , en général, gastro-intestinale, dont on peut rapporter la cause à une mêmeorigine alimentaire.

35. 6 – 24 – 48 u Repas Symptômes Hôpital Médecins Labo clinique AFSCA (Fédéral) Souche Inspection de santé (Communautés) Formulaire d’enquête Procedure (SOP) Données Denrées suspectes ISP Centre de référence Epidémiologie

36. Salmonella • 95% des salmonelloses humaines sont d’origine alimentaire (Institut de veille sanitaire -F) • En 2004: 9965 personnes en Belgique • 2 à 6% des cas de salmonellose sont rapportés comme liés à uneTIAC

37. L’enquête lors d’une Toxi-infection alimentaire • Analyses de laboratoire (patients et denrées) • Enquête épidemiologique restreinte ou approfondie But: Détecter l’agent étiologique(ex. Salmonella), la denrée et la cause (ex. réfrigération insuffisante) pour • Traiter les malades • Eviter d’autres malades • Prendre des mesures préventives dans la chaîne alimentaire

38. Contenu • Definitions et situation belge • Une TIAC simple • Une épidémie en Belgique • Une épidémie internationale

39. Etude de cas : Une toxi-infection collective générale par Salmonella Enteritidis dans un hôtel à Bruxelles Ref: Aerts A. en Gilbert V. Epidemiologisch onderzoek van een voedseltoxi-infectie in Brussel IPH/EPI reports N°2002–010 Depot nr. : /2002/2505/17

40. Case-study : • Enquête épidémiologique : Retrospective cohort study Enquête écrite (anonyme) • Analyses de laboratoire Analyse des restes de repas Coproculture du personnel Souches isolées: typage moléculaire

41. Description du cas • Jeudi 13 et vendredi 14/4/01: Session de formation d’une grande entreprise pour son personnel (180p) dans un hôtel à Bruxelles • Lundi 17/4: • 50 personnes absentes au travail, 2 hospitalisés • L’hôtel fait analyser 18 échantillons • L’inspection de Santé de Bruxelles est avertie: Début d’une enquête scientifique avec l’ISP • Mardi 18/4: L’AFSCA est avertie.

42. Rassemblement des données • Menu? • Qui a préparé le repas? • Où a-t-il été préparé ? • Quand a-t-il été préparé ? • Hygiène et T-contrôle? • Anamnèse des précédents évènements?

43. Menu • Sandwiches au saumon mariné, mousse de foie gras, crevettes grises, jambon de Parme, salade de thon, salade de saumon, brie, fromage, filet Américain, rôti de veau • Quiche au saumon fumé • Salades et sauces • Pâtisserie • Bière, vin, eau, jus de fruits, café, thé

44. Qui, où et quand? • Le personel de cuisine de l’hôtel, le jour même • 25L mayonnaise préparé avec 75 oeufs et divisé en 4 pour les sauces • Crème épaisse, saumon mariné (congelé), mousse de foie gras et rôti de veau(cuisson sous vide) ont été achetés

45. Enquête épidémiologiqueRèsultats: • 78% ont rempli le questionnaire • AR: 66.1% • Consultation médecin: 50% • Coproculture : 7+ /9 invités • Coproculture personnel: négatif • Denrées ad risk (95% intervalle de confiance) Américain: RR 9.1(3.1-26) Salade de saumon: RR 29.1 (3.6-238) Brie: RR 2.3(0.9-6.2)

46. Résultats analyse des denrées • Mayonnaise:Salmonella Enteritidis • Saumon fumé: Salmonella Enteritidis • Brie:Salmonella Enteritidis • Salade de thon: Salmonella Enteritidis Typage moléculaire : profil identique des souches isolées des patients

47. Contenu • Definitions et situation belge • Une TIAC simple • Une épidémie en Belgique • Une épidémie internationale

48. Etude de cas : Une épidémie à Salmonella Ohio en Belgique

49. Salmonella Ohio en Belgique

50. Observations • Augmentation de S.Ohio isolées chez des patients • S.Ohio isolée durant monitoring zoonose de l’AFSCA? • Oui, alors comparaison des profils moléculaires • Si profils identiques: retracer l’origine